به گزارش حیات ، با تصویب لایحه انجمن های ایالتی و ولایتی و لوایح ششگانه انقلاب به اصطلاح سفید شاه، چهره ضد دینی حکومت پهلوی بیشتر از گذشته برای مردم آشکار شد.ملت و روحانیون مبارز به این اقدامات اعتراض کردند و امام خمینی(ره) که در راس حرکت های مردمی قرار داشتند، متعاقب اقدامات ضد ملی و اسلامی شاه نخستین اعلامیه خود را بصورت محرمانه برای بعضی از علمای شهرها ارسال کردند.در این اعلامیه امام(ره ) مرقوم فرمودند : خدمت ذی شرافت‏ حضرات علماء اعلام و حجج اسلام دامت‏برکاتهم. چنانچه اطلاع دارید دستگاه حاکمه می‏خواهد با تمام کوشش به هدم احکام ضروریه اسلام قیام و به دنبال آن مطالبی است که اسلام را به خطر می‏اندازد لذا این‏جانب عید نوروز را به عنوان عزا و تسلیت‏به امام عصر (عج) جلوس می‏کنم و به مردم اعلام خطر می‏نمایم، مقتضی است‏حضرات آقایان نیز همین رویه را اتخاذ فرمایند تا ملت مسلمان از مصیبت‏های وارده بر اسلام و مسلمین اطلاع حاصل نمایند .رژیم پهلوی با پی بردن به متن این اعلامیه محرمانه و حرکت های انتقادی در حوزه های علمیه؛ روحانیون را بزرگترین مانع اهداف سوء، خود فرض کرد و در توطئه ای از پیش طرح ریزی شده به قصد تضعیف چهره حوزه و اساتید آن، در روز دوم فروردین 1342، مصادف با شهادت امام جعفر صادق(ع) در آن سال، زمانی که طلاب مشغول عزاداری بودند، ماموران رژیم به مدرسه فیضیه حمله کردند و پس از مقاومت طلاب، به روی آنها آتش گشودند و عده زیادی از طلاب را شهید و یا مجروح کردند.در این هجوم ددمنشانه؛ ماموران رژیم در غیر انسانی ترین برخوردها عده ای از طلاب را از بالای پشت بام مدرسه فیضیه به پایین انداخته و فجایع بسیاری را به بار آوردند و به غارت کتاب ها و وسایل آنها پرداختند.اگرچه رژیم قصد داشت با این توطئه قدرت خود را به روحانیون مبارز نشان دهد و آنها را وادار به عقب نشینی و سکوت در برابر نیات و اهداف سوء خود نماید، اما با رهبری هوشیارانه و جامع امام خمینی (ره) این جنایت هولناک بعنوان لکه ننگی بر دامان رژیم، در تاریخ ثبت شد.امام خمینی(ره) در همان روز در برابر مردم عزادار فرمودند: دستگاه حاکمه با این جنایت، ‏خود را رسوا و مفتضح ‏ساخت و ماهیت چنگیزی خود را به خوبی نشان ‏داد دستگاه جبار با دست‏زدن به این فاجعه شکست و نابودی خود را حتمی ساخت. ما پیروزشدیم ما از خدا می‏خواستیم که این دستگاه ماهیت ‏خود را بروز دهد و خود را رسوا کند ... امروز وظیفه ماست که در برابر خطراتی که متوجه اسلام و مسلمین می‏باشد برای تحمل هرگونه ناملایمات آماده‏باشیم تا بتوانیم دست ‏خائنین به اسلام را قطع‏ نمائیم و جلو اغراض و مطامع آنها را بگیریم... هرچند رژیم پهلوی با هتک حرمت به این مکان دینی و علمی قصد قدرت نمایی و سرکوب مخالفان را در سر می پروراند اما این اقدام نابخردانه و درایت امام خمینی(ره) در برخورد با آن، شرایط مناسب را برای آشنائی مردم با دیدگاههای ایشان فراهم آورد و سبب تثبیت تفکر سیاسی امام خمینی(ره) در جامعه و زمینه ساز پیروزی انقلاب اسلامی در سال 1357 شد.